由于养殖废水中的剩余残饵和养殖生物排泄物等大部分以悬浮态大颗粒形式存在，这也是造成水产养殖水污染的主要原因。在处理过程中，应及时清掉，减少负荷，以免堵塞。常用的机械过滤设备有微滤机。在实际的处理工程中，微滤机是一种应用比较好的过滤方式。它是一种机械物理过滤方法，在循环水养殖水处理中具有良好的应用成效。它能去掉大量的水（纤维、颗粒、薄片等）中的浮游生物和残留的饵料、粪便和其他污物。微滤是减低生物处理负荷、上升水处理效率的成效、经济的方法。
       微滤系统要安装在循环水养殖系统的水处理过程中。它去掉循环水中固体悬浮物对生物滤池硝化作用有很大的影响。虽然氨氮转化菌生长需要一些有机物，但鱼类排泄物和饵料残渣使水产养殖水体中有机质含量较高。有机质过多会导致有机消化菌的繁殖，并与生物膜中的氨氮转化菌竞争，从而产生空间、溶解氧和营养物质。有机消化细菌的繁殖速度快于氨氮转化菌，在养殖系统生物滤池中氨氮去掉率较低。减少养殖废水对环境的影响，节约水资源，具有很大的经济效益。
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